Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP4Q969E2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms