Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC4Q92889 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms