Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1AQ92747 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1AQ92747 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms