Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A3Q92570 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A3Q92570 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A3Q92570 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms