Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BAP1Q92560 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms