Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms