Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRIM41Q8WV44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRIM41Q8WV44 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM41Q8WV44 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms