Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC12Q8WUD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms