Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSH3Q8TE77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SSH3Q8TE77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms