Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT2Q8TDY3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT2Q8TDY3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT2Q8TDY3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT2Q8TDY3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT2Q8TDY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT2Q8TDY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms