Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFP28Q8NHY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFP28Q8NHY6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZFP28Q8NHY6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms