Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF169Q8NCN4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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