Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH13Q8NBN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms