Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATG16L2Q8NAA4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms