Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms