Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3Q8N9I9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms