Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms