Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAF1Q8N7H5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAF1Q8N7H5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms