Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf53Q8N3J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms