Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML4Q8N228 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML4Q8N228 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms