Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC47Q8N1G4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC47Q8N1G4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms