Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPICE1Q8N0Z3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPICE1Q8N0Z3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms