Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN4BQ8IWT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.9 ms