Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3BQ8IVW6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3BQ8IVW6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3BQ8IVW6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms