Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB1Q86U70 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms