Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS9Q7Z410 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS9Q7Z410 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS9Q7Z410 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms