Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER4Q7RTX7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CATSPER4Q7RTX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CATSPER4Q7RTX7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER4Q7RTX7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER4Q7RTX7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms