Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms