Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP2Q7RTS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms