Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP3Q7RTS5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms