Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY3Q7L099 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms