Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD4Q76G19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms