Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP34Q70CQ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms