Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms