Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM43BQ6ZT52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM43BQ6ZT52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms