Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSMFQ6X4W1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms