Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms