Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms