Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC41PQ6P2S7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC41PQ6P2S7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms