Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms