Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN13Q6MZZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms