Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDE2Q6IQ49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms