Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.54■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
OTUD7BQ6GQQ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms