Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL2Q6F5E8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms