Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA3Q6AZY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA3Q6AZY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms