Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC102BQ68D86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms