Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4F1Q66K89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms