Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf146Q5VVC0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms