Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MYOM3Q5VTT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MYOM3Q5VTT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MYOM3Q5VTT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MYOM3Q5VTT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms