Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFI1BQ5VTD9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms